Гепаторенальный синдром дифференцируют от других причин сочетанного поражения печени и почек, поскольку эти заболеваний, требуют иной терапии и, как правило, отличающихся более благоприятным прогнозом. Особенно важно разграничить гепаторенальный синдром с острым канальцевым некрозом при токсических нефропатиях, апостематоз, нефрит, тяжелой инфекцией (сепсис, вызванный грамотрицательной флорой, острый холангит, лептоспироз, лихорадка), анурией при декомпенсированной недостаточности кровообращения с низким сердечным выбросом, с печеночно-почечной недостаточностью острой жировой дистрофии печени у беременных (синдром Шихена).